同济大学核受体研究新成果

来源:生物通 时间:2011/12/08 09:48 阅读:417
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  近日来自同济大学生命科学学院的研究人员在国际著名肿瘤学杂志《Cancer Research》发表了题为“A Comprehensive View of Nuclear Receptor Cancer Cistromes”的研究论文,公布了关于核受体研究的新的进展。

  领导这一研究的是现任哈佛大学公共卫生学院生物统计系副教授,同济大学生命科学与技术学院兼职教授的刘小乐博士。其主要研究工作侧重于基因调控机制的生物信息和计算生物学研究。通过整合全基因组ChIP-chip/Seq、核小体定位、组蛋白修饰、基因表达谱、基因组序列等数据。构建转录与表观遗传调控的计算和统计模型。

  在这篇文章中,研究人员通过整合和分析现有的核受体ChIP-chip/seq数据,揭示了有关核受体调控机理的一些有意义现象:核受体识别的非典型模体,与其共同作用的先导因子特点,其结合位点的强度/保守性和功能性的关系,及其在转录调控中的作用。

  该工作通过整合同一细胞株和条件下同一转录因子的全部ChIP-chip/seq数据和与之匹配的全部差异表达数据,建立了一个新的模型预测转录因子直接调控的基因。并提出了不同类型高通量数据整合研究转录调控机制的新思路。

  本研究工作是在刘小乐教授的指导下,主要由同济大学生命科学院博士研究生唐茜子完成。该研究工作得到了科技部的经费支持。

  核受体相关链接:核受体是与类固醇激素受体同源的一类配体依赖性转录因子超家族,机体的生长发育、细胞分化,以及体内许多生理、代谢过程都可归因于核受体与相应配体及众多共调节因子相互作用所调控的基因网络的协调表达。因此,核受体在癌症等多种疾病中也扮演着非常重要的角色。

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