伯科生物推出自主知识产权的生物液相芯片杂交捕获与探针原位合成技术
近日,测序中国获悉,伯科生物医学科技(北京)有限公司(以下简称“伯科”)已建成完整的杂交捕获探针设计与原位合成平台(BOKE TargetCap™),拥有了自主知识产权的液相芯片杂交捕获技术,实现了中国早创。BOKE TargetCap™生物液相芯片杂交捕获技术通过对目标区域的深入分析,能够综合考虑目标区域GC含量、目标区域重复性、探针非特异性杂交特性、探针退火温度、杂交解链热动力学特性等因素,筛选出较 优方案,更大程度满足实验需求。
据悉,伯科的研发团队由全球知名的化学和生物学专家组成,拥有自主知识产权的合成技术平台,实现了真正意义上的不依赖任何进口仪器的独立自主生产能力。现有的基因捕获技术大都使用生物素修饰的DNA进行杂交,主要是利用生物素与链霉亲合素(streptavidin, SA)之间结合的亲合力高、特异性强的特点。生物素分子有两个环状结构,其中咪唑酮环是与亲和素结合的主要部位;另外一个噻吩环的C2上有一戊酸侧链,可以提供一定的空间距离,但是并不足够。因此生物素和DNA一般通过一段有机长链状分子连接,其距离可以调节。
通常采用的有己烷链、triethyleneglycol(TEG)链或者其他长度的链等,DNA复制时掺入的Biotin-16-dUTP采用了16个原子长度的有机分子链。伯科的研发团队通过对分子结构进行优化与创新,合成了一系列不同长度连接的生物素亚磷酰胺分子,较长的达到40个原子长度。同时精深的研究了生物素和DNA之间有机长链状分子的不同空间距离,对于目标区域捕获的影响。通过这一系列不同长度连接分子的生物素分子配合二代测序技术,测定不同长度的捕获效率,发现随着长度的增加,捕获效率得到有效提高。
元码基因研发总监梁羽表示:“经过大量的临床样本验证,伯科的BOKE TargetCap™在捕获效率、产品稳定性、准确度、灵敏度等指标上均达到甚至超过国际知名品牌水平,未来将在临床应用方面具有广阔的前景”。
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