这种罕见的免疫细胞竟可预防癌症复发，改善临床结果
来源：医生在线
时间：2021/05/25 17:21
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肾癌是癌症免疫疗法敏感的恶性肿瘤之一。与其他癌症相比，肾癌的免疫特性更为突出；与大多数其他实体瘤相比，肾癌有更多的免疫细胞浸润。
但经过治疗后的肾癌并非都万事大吉。肾透明细胞癌(ccRCC)是一种异质性疾病，也是常见的肾癌。经过手术治疗后，它的癌症复发率高达40%，并发展为无法治好的转移性疾病。这究竟发生了什么？
为了揭示浸润肾癌的免疫细胞的细微细节，研究人员结合了癌症研究中的两种新技术。
首先，是单细胞RNA测序（scRNA-seq）。为了组装全面的ccRCC肿瘤微环境（TME）图谱，研究人员对未经治疗的ccRCC切除肿瘤和邻近肿瘤组织的造血和非造血亚群进行了单细胞RNA测序。
但scRNA-seq技术存在一个很大的弊端：它会丢失高达90％的基因活性，这种现象也被称为基因缺失（genedropout)。
接着，研究人员采用VIPER算法（VIPER蛋白质活性）相结合，解决了基因缺失的问题。它可以准确检测细胞中所有调节基因的70％至80％的活性，从而消除基因缺失的影响。
研究人员利用该组合方法分析了从哥伦比亚泌尿外科接受手术的11例患有透明细胞肾癌的患者中取出的200,000多个肿瘤细胞和正常组织中的正常细胞。
他们通过对单细胞蛋白质活性进行定量，并与流式细胞术进行比较验证了该方法。该分析确定了关键的TME亚群及其主要调控因子和候选细胞之间的相互作用，从而揭示了临床相关人群（这些人群无法通过基因表达分析检测到）。
具体来说，研究人员发现了以TREM2/APOE/C1Q上调为特征的肿瘤特异性巨噬细胞亚群，并通过空间分辨、免疫荧光染色进行了验证。在大型临床验证队列中，这些标志物在手术后复发的患者的肿瘤中显著丰富。
因此，该研究确定了TREM2/APOE/C1Q阳性巨噬细胞浸润是ccRCC复发的潜在预后生物标志物，也是候选的治疗靶标。
这些数据提出了一种有趣的可能性，即这些细胞不仅是更具危险性的疾病的标志物，而且实际上可能导致该疾病的复发和进展，靶向这些细胞可以改善临床结果
为了揭示浸润肾癌的免疫细胞的细微细节，研究人员结合了癌症研究中的两种新技术。
首先，是单细胞RNA测序（scRNA-seq）。为了组装全面的ccRCC肿瘤微环境（TME）图谱，研究人员对未经治疗的ccRCC切除肿瘤和邻近肿瘤组织的造血和非造血亚群进行了单细胞RNA测序。
但scRNA-seq技术存在一个很大的弊端：它会丢失高达90％的基因活性，这种现象也被称为基因缺失（genedropout)。
接着，研究人员采用VIPER算法（VIPER蛋白质活性）相结合，解决了基因缺失的问题。它可以准确检测细胞中所有调节基因的70％至80％的活性，从而消除基因缺失的影响。
研究人员利用该组合方法分析了从哥伦比亚泌尿外科接受手术的11例患有透明细胞肾癌的患者中取出的200,000多个肿瘤细胞和正常组织中的正常细胞。
他们通过对单细胞蛋白质活性进行定量，并与流式细胞术进行比较验证了该方法。该分析确定了关键的TME亚群及其主要调控因子和候选细胞之间的相互作用，从而揭示了临床相关人群（这些人群无法通过基因表达分析检测到）。
具体来说，研究人员发现了以TREM2/APOE/C1Q上调为特征的肿瘤特异性巨噬细胞亚群，并通过空间分辨、免疫荧光染色进行了验证。在大型临床验证队列中，这些标志物在手术后复发的患者的肿瘤中显著丰富。
因此，该研究确定了TREM2/APOE/C1Q阳性巨噬细胞浸润是ccRCC复发的潜在预后生物标志物，也是候选的治疗靶标。
这些数据提出了一种有趣的可能性，即这些细胞不仅是更具危险性的疾病的标志物，而且实际上可能导致该疾病的复发和进展，靶向这些细胞可以改善临床结果
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