张泽民等团队揭示大肠癌患者肿瘤反应性CD8 + T细胞的独特表观遗传特征
肿瘤反应性CD8型肿瘤浸润淋巴细胞(T ILs)是一种T细胞亚型,能特异性识别和破坏肿瘤。了解肿瘤反应性CD8+T细胞的调控机制具有重要的治疗意义.然而,这种T细胞亚型的DNA甲基化状态尚未阐明。
2019年12月31日,北京大学生命科学学院张泽民,任仙文和首都医科大学彭吉润共同通讯在Genome Biology上在线发表了题为Distinct epigenetic features of tumor-reactive CD8+ T cells in colorectal cancer patients revealed by genome-wide DNA methylation analysis的研究论文。该研究表明DNA甲基化参与肿瘤反应CD8T IL的形成,并为开发新的DNA甲基化标记和未来的治疗提供了宝贵的资源。
2019年10月31日,北京大学张泽民,任仙文,首都医科大学彭吉润及勃林格殷格翰药业有限公司Liu Kang共同通讯在Cell 在线发表题为“Landscape and Dynamics of Single Immune Cells in Hepatocellular Carcinoma”的研究论文,该研究结合两种单细胞RNA测序技术,从五个与免疫相关的部位【肿瘤,邻近肝脏,肝淋巴结(LN),血液和腹水】为HCC患者产生了CD45 +免疫细胞的转录组。该研究对来自不同组织部位的免疫细胞的全面表征揭示了免疫细胞在癌症环境中的动态特性。该研究分析揭示了TME,LN和腹水中髓样和淋巴样细胞的不同谱系和迁移关系。为了促进更多研究人员使用该研究的数据,研究人员开发了一种基于Web的交互式工具,用于为一个或多个用户分析和可视化的单细胞数据 输入基因。该研究数据可以为进一步研究提供宝贵的资源,以获取更深入的生物学见解,从而为当前的肝癌免疫疗法带来新的治疗靶点和反应的生物标志物。
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