好消息!科学家开发出更高活性的腺嘌呤碱基编辑器
美国 Beam Therapeutics公司Giuseppe Ciaramella、Nicole M. Gaudelli等研究人员,合作开发了具有更高活性和更广应用前景的腺嘌呤碱基编辑器。相关论文于2020年4月13日在线发表于《自然—生物技术》。
研究人员使用腺苷脱氨酶变体库进一步进化了ABE7.10,从而产生了ABE8。与ABE7.10相比,在NGG原型间隔子相邻基序(PAM)位置,ABE8在原型间隔位A5-A7处的编辑度高约1.5倍,在位置A3-A4和A8-A10处的编辑度约高3.2倍。非NGG PAM变体的总体目标编辑效率比ABE7.10高约4.2倍。
在人类CD34+细胞中,ABE8可以在γ-珠蛋白基因HBG1和HBG2的启动子上重建天然等位基因,效率高达60%,从而使得胎儿血红蛋白持续存在。在原代人类T细胞中,ABE8可实现98-99%的靶标修饰,当在三个基因座上多重修饰时,该高 效率仍得以维持。
作为信使RNA传递,ABE8在基因组DNA中不会诱导显著水平的不依赖单个向导RNA(sgRNA)的脱靶腺嘌呤脱氨,而在细胞mRNA中只产生非常低水平的腺嘌呤脱氨。
据了解,基础的腺嘌呤碱基编辑器(例如,ABE7.10)能够编辑A•T到G•C的点突变,但在修饰原代人类细胞中的基因座时,编辑效率可能很低。
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