【Nature子刊】基因大筛查!确定191个乳腺癌的靶基因!
2017年,多项研究通过已全基因组关联分析(GWAS)寻找到150个乳腺癌相关的基因易感区段,但由于随机采样导致的抽样误差以及单核酸多态分子(SNP)之间复杂的连锁不平衡,GWAS定位到通常只是致病位点的相关区域,其结果具有一定复杂性和不准确性。
基于以上研究,剑桥大学的Alison Dunning课题组1月8日于Nature Genetics发表工作,分析了乳腺癌组织联合会(BCAC)中217,000多名受试者的基因组数据,通过精细定位技术(fine-mapping)在原先发现的150个易感基因区段中准确定义了191个风险基因,为临床癌症风险评估提供可靠依据,同时为乳腺癌发生机制的研究指明新的方向!
较后,研究者们通过分析基因的分子功能、细胞组分和参与的生物学过程这样一个“基因本体论(GO)”途径来发现新的靶基因。值得注意的是,14%的靶基因与免疫系统途径有关,在ER阴性的乳腺癌相关基因中这个比例达到19%,尤其是涉及T细胞活化、白细胞介素信号传导、Toll样受体级联反应和I-κB激酶/NF-κB信号传导等介导先天免疫系统活化和以及的过程。
这项研究通过定位技术,明确乳腺癌风险信号对应的基因突变,并定义了这些变异的靶基因。尽管大多数靶基因所对应的下游通路机制基础尚不清晰,但这对现有相关通路研究的方向作扩充和延伸,为乳腺癌易感性和发病机制等生物学研究奠定基础,并为临床作乳腺癌风险筛查提供强有力的证据!
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