大肠杆菌基因组的结构和相互作用
据了解2月13日《细胞》上发发表了一项研究成果。是由美国德克萨斯大学奥斯汀分校Rasika M. Harshey和密歇根大学Peter L. Freddolino合作,通过充分混合的大肠杆菌基因组追踪Mu转座揭示了其广泛联系。
染色体的三维结构在细胞调控状态中起着重要作用,被越来越多地认识到。利用噬菌体Mu转座的效率和混杂性来直接测量大肠杆菌中基因组基因座之间的体内相互作用。
已经出现了两种总体组织原则:首先,染色体是充分混合且没有隔室的,在所有测定的基因座之间自由发生转座。第二,几个基因家族/区域表现出“聚集”:无论线性基因组距离如何,都会出现强三维共定位。SMC /凝缩蛋白MukB和核凝缩蛋白亚基HU-α的活性对于充分混合状态是必不可少的。HU-α对于6/7核糖体RNA编码基因座的聚集也是必需的。模型可以解释数据,该模型中的染色体结构由DNA复制和染色体松弛之间的动态竞争驱动,为确定区域特异性如何对染色体结构和基因调控做出贡献提供了基础。
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