揭示RNA标记新方法
来源：互联网
时间：2020/02/27 21:57
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在《自然—遗传学》上发表过，由美国德克萨斯大学MD安德森癌症中心P.AndrewFutreal研究组发现人癌细胞中基因组重排破坏染色质折叠结构域。
国 际癌症基因组协会（ICGC）和癌症基因组图谱（TCGA）的全基因组全癌基因分析（PCAWG）联盟汇总了来自38种肿瘤类型的2658例癌症患者的全基因组测序数据，作为该联盟的一部分，他们分析了288,457个躯体结构变异（SV），以了解SV在整个拓扑关联域（TAD）中的分布和影响。值得注意的是，SV可以导致离散TAD融合，复杂的重排显著改变癌症基因组中的染色质折叠图谱。值得注意的是，只有14％的边界缺失导致附近基因表达的变化超过两倍。
据悉，通过组织线性DNA染色质可折叠成连续的层。相同的TAD中的基因表现出相似的表达和组蛋白修饰图谱，并且分隔不同结构域的边界在增强这些功能的稳定性方面具有重要作用。实际上，人类癌症中的结构域破坏会导致基因表达的失调。然而，人类癌症中结构域破坏的频率仍不清楚。
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